Свои первые профессиональные шаги Рахимов сделал, работая после окончания медицинской академии врачом–ангиохирургом в Акмолинской областной больнице. В 2005 году он прошел стажировку по интервенционной рентгенохирургии в институте им. Вишневского в Москве Российской Федерации. И после стажировки продолжил свою трудовую деятельность врачом–рентгенохирургом в Акмолинской областной больнице. В 2006 - 2007 годы Бахтияр Ерикович проходил стажировку по интервенционной рентгенэндоваскулярной хирургии в Литве – в прославленном Каунасском медицинском университете. В 2007 году Рахимов впервые в Акмолинской областной больнице организовал службу кардиохирургической помощи. Впервые на уровне городских больниц Республики Казахстан здесь была успешно проведена операция «Установка системы Стент–графт» пациентам. А также в рамках оказания ВСМП гинекологическим пациентам была проведена операция эмболизация маточных артерий с диагнозом «кровотечение при симптоматической миоме матки, шеечной беременности». Это операция, позволяющая избежать тяжелых осложнений после экстирпации (удаления) матки, в других случаях – помогающая сохранить репродуктивную функцию женщины и дать возможность в будущем испытать чувство материнства.